Kohlendioxid, auch bekannt als Kohlensäure (CO2), spielt eine wesentliche Rolle für das Wachstum von Wasserpflanzen. Wenn genügend freies CO2 vorhanden ist, können Wasserpflanzen gedeihen und unter Lichteinfluss organische Stoffe umwandeln, wobei Sauerstoff freigesetzt wird. Dieser Prozess wird als Assimilation bezeichnet. Der CO2-Gehalt im Wasser schwankt im Laufe des Tages aufgrund der Tages- und Nachtaktivität. Unterwasserpflanzen nehmen tagsüber CO2 auf und geben Sauerstoff ab, während sie nachts Sauerstoff aufnehmen und CO2 abgeben, wenn auch in begrenztem Umfang.

Mikroorganismen sind die Hauptproduzenten von CO2 und produzieren sowohl tagsüber als auch nachts. Das bedeutet, dass sich CO2 in der Nacht anreichern und am Nachmittag deutlich abnehmen kann. Dieser Prozess findet jedoch nur in gut funktionierenden Gewässern statt, in denen es wachsende Unterwasserpflanzen und eine ausreichende Aktivität von Mikroorganismen gibt. Der pH-Wert kann diesen Prozess steuern. Ein gut funktionierendes Teichmilieu ist gekennzeichnet durch einen relativ niedrigen pH-Wert (pH 7-8) am frühen Morgen und einen relativ hohen pH-Wert (pH 8-9) am Abend. In diesem Fall wachsen die Pflanzen gut und das Wasser ist klar. Ist der pH-Wert jedoch sowohl morgens als auch abends hoch (pH 9 oder höher), deutet dies auf eine Stagnation hin, bei der die Unterwasserpflanzen nicht wachsen und der Teich voller Algen ist.

Nach der Wachstumsperiode sinkt der pH-Wert und das Wachstum von Wasserpflanzen und Algen stagniert. Sie nehmen dann kein CO2 mehr auf und der CO2-Gehalt im Teich steigt langsam an. Wenn der GH-Wert (siehe Kapitel GH) hoch genug ist, kann das überschüssige CO2 an Karbonat gebunden werden, so dass das Wasser nicht sauer wird und der pH-Wert nicht unter pH 7 fällt. Ist der GH-Wert jedoch zu niedrig, ist nicht genügend Calcium vorhanden, um das überschüssige CO2 zu binden. Dies führt zu einer Übersäuerung des Wassers und zu Sauerstoffmangel. In diesem Fall sinkt der pH-Wert auf Werte unter pH 6. Mit einem einfachen Aqua-Test-Set kann der pH-Wert genau bestimmt werden.